La Prisión en Mobile Strike es el edificio que nos permite retener a los comandantes enemigos si los hemos capturado después de un ataque.
Solo podemos retener a los comandantes que tengan un Cuartel General igual o superior a nivel 10.
Si entramos en la Prisión podremos ver los comandantes que hemos capturado y el tiempo que falta para ser liberados.
Si mientras tenemos a un Comandante capturado nos atacan a la base y sufrimos una derrota nuestro Comandante capturado puede escaparse y perderemos los puntos de comandante que íbamos a recibir.
Si tenemos a un comandante retenido en nuestra Prisión veremos un logo encima de ella indicando que tenemos algún comandante retenido.